メンバー
;近藤勇
:二代目局長であり、作品内でも「局長」と言われているのは主に彼。
:人物の描写がないため人間性は不明。
:戊辰戦争では奮戦したが捕えられ、斬首された。
;[[芹沢鴨]]
:初代局長。
:辣腕だったが乱暴者で素行が悪く、土方らに暗殺された。
:新選組に対しては「尽忠報国のための組織であり、国を改善する為に自分に率いられるべき」という思想を持っていた。
;[[山南敬助]]
:元総長。
:芹沢の暗殺にも参加していたが、その事がずっと心残りだったようで、ついていけなくなって脱走して捕えられて切腹した。
:新選組に対しては「どうあるべきか」でずっと悩み続けており、『ぐだぐだ邪馬台国2020』では「身内を殺すべきではなく、助け合うべきだった」という結論に至った。
;[[土方歳三]]
:副長。「鬼の副長」と呼ばれ、拷問などの後ろ暗い部分を引き受けていた。
:戊辰戦争では最後まで戦い抜き、函館で戦死したとされているが、死体は確認されていない。
:メンバーが次々と抜けていく中でも戦い続けたからか、「俺が新選組だ」という狂的な信念に至っている。
;[[沖田総司]]
:一番隊隊長。女性。
:「猛者の剣」と呼ばれた剣の達人であったが、結核によって戊辰戦争に参戦することなく病没。
:そのことを気に病んでおり、「新選組として最期まで戦い抜きたかった」と後悔を抱えている。
;[[永倉新八]]
:二番隊隊長。
:「最強の剣」と呼ばれた剣の達人。
:山南の切腹時には「その遠慮のない物言いが新選組には必要だ」と評価されていた。
:次第に変質して追い詰められていく新選組と袂を分かち、天寿を全うした。
:そのために「新選組にいた事自体が間違っていたのではないか」という想いから新選組にいた頃を自分の全盛期を思うことができず、召喚される際も晩年の老人の姿となっている。
;[[斎藤一]]
:三番隊隊長。
:「無敵の剣」と呼ばれた剣の達人。
:戊辰戦争では会津のあたりまでは戦ったが降伏し、後に警視庁で働いたりした後、天寿を全うした。
:「自分は面白い方に行く」と新選組に対しては突き放した見方をしているが、土方曰く「彼は絶対に新選組を裏切らない」とのことで、実際に新選組の皆の行く末についても思いを馳せていた。
;武田観柳斎
:五番隊隊長。
:コハエースにおいて沖田の台詞から存在が示唆されている。
;原田
:芹沢鴨暗殺や池田屋事件の際にしばしば同行していた隊士。
:明言されていないが、おそらく十番隊隊長の「原田左之助」。
:山南の切腹時には「その憎めない性格が皆の助けになる」と評価されていた。
;[[伊東甲子太郎]]
:新選組で参謀兼文学師範を務め、後に脱退して御陵衛士を組織するも新選組に暗殺された。
:山南の切腹時には「伊東先生」と呼ばれ、「皆に知恵を貸してほしい」と頼まれていた。
;[[服部武雄]]
:新選組の五番隊に所属していた隊士であり、心酔している伊東と共に御陵衛士に加わり、暗殺された。
:上記の永倉が「新選組の最強は服部」と言及するような達人であった。
;藤堂
:山南の切腹時には「これは私の責任だから近藤を恨んではいけない」と諭されていた。
:明言されていないが、おそらくは八番隊隊長を務め、後に御陵衛士に加わり伊東ともども暗殺された「藤堂平助」。
;源三郎
:山南の切腹時には「貴方のような人が大事なのです」と敬われていた。
:明言されていないが、おそらくは六番隊隊長を務め、鳥羽・伏見の戦いで死没した「井上源三郎」。
;市村
:『Fate/Grand Order』の土方歳三の[[幕間の物語]]『あの人の事』にて、[[主人公 (Grand Order)|主人公]]が視点を借りて新選組の興亡を追体験した隊士。
:一番最後の五稜郭まで同行するものの、土方の遺品と写真を日野の実家まで届けた。
:明言されていないが、おそらくは土方歳三の小姓を務めていたとされる「市村鉄之助」。
;大石
:油小路の変で伊東の暗殺に向かったメンバーの代表。
:明言されていないが、おそらくは一番隊に所属していた「大石鍬次郎」。